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海爾生物醫(yī)療新guan肺炎檢測(cè)PCR實(shí)驗(yàn)室建設(shè)場(chǎng)景方案一 成都壹科醫(yī)療器械有限公司
自新型guan狀病毒發(fā)現(xiàn)以來(lái),特別是PCR實(shí)驗(yàn)室新型guan狀病毒核酸檢測(cè)工作任務(wù)艱巨。先介紹一下PCR檢測(cè)的流程:
1 試劑制備區(qū)
功能:主要是作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應(yīng)混合液的制備,試劑和用于標(biāo)本制作的材料應(yīng)直接運(yùn)送至該區(qū),不得經(jīng)過(guò)其它區(qū)域。試劑原材料需貯存在本區(qū)內(nèi),并在本區(qū)內(nèi)制備成所需的貯存試劑。所需要的儀器設(shè)備:
天平(用于精確稱量各類試劑)→超凈工作臺(tái)(涉及對(duì)細(xì)菌的操作均需在超凈工作臺(tái)下完成)→移液器(準(zhǔn)確量取特定體積溶液20-100ul)→純水(超純水18.2ΩM.CM)→藥品冷藏箱(短期保存 )→試劑低溫冰箱(可選2-8°、-20℃)→混勻儀(移取樣本前需要混勻)(推薦艾本森品牌:MixMax漩渦混勻儀)→消毒車(空間環(huán)境消毒)→滅菌鍋(實(shí)驗(yàn)室物品、試劑、培養(yǎng)基消毒滅菌)→PH計(jì)(配置試劑是精確測(cè)量PH值)
2 樣本制備區(qū)
功能:臨床標(biāo)本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴(kuò)增反應(yīng)管和測(cè)定RNA時(shí)DNA的合成。所需要的儀器設(shè)備
生物安全柜(為了防止有害懸浮微粒、氣溶膠的擴(kuò)散)→樣本低溫冰箱(-20℃,-80℃保存樣本及DNA)→高速臺(tái)式冷凍離心機(jī)(用于收集微生物菌體、細(xì)胞碎片以及其他沉淀物,有些樣品由于在常溫下不太穩(wěn)定,需要低溫環(huán)境)→恒溫金屬浴(用于DNA雜交過(guò)程中水浴控溫)(HtPot40恒溫金屬?。?rarr;移液器(準(zhǔn)確量取特定體積溶液)→紫外燈或者消毒車(空間環(huán)境消毒)→混勻儀(移取樣本前需要混勻)(推薦艾本森品牌:MixMax漩渦混勻儀)→超凈工作臺(tái)(涉及對(duì)細(xì)菌的操作均需在超凈工作臺(tái)下完成)→低溫?fù)u床(用于大腸桿菌和酵母菌的振蕩培養(yǎng))→磁力攪拌器(加速溶解固體內(nèi)容物 )
3 核酸擴(kuò)增區(qū)
功能:主要是DNA擴(kuò)增,已制備的DNA模板和合成的DNA和主反應(yīng)混合液,制備成反應(yīng)混合液等,也可以在本區(qū)域內(nèi)進(jìn)行。在PCR測(cè)定中,通常在擴(kuò)增后須打開反應(yīng)管。
基因擴(kuò)增儀 (基因檢測(cè)DNA/RNA擴(kuò)增)→熒光定量PCR儀(核酸定量分析)→核酸提取儀(樣品DNA/RNA提?。?rarr;移液器(準(zhǔn)確量取特定體積溶液)→紫外燈或者消毒車 (空間環(huán)境消毒)→超凈工作臺(tái)(涉及對(duì)細(xì)菌的操作均需在超凈工作臺(tái)下完成 )→純水裝置(用于PCR,DNA測(cè)序需要超純水)
4 產(chǎn)物分析區(qū)
功能:主要進(jìn)行的操作為擴(kuò)增片段的測(cè)定,如使用全自動(dòng)封閉分析儀器檢測(cè),需要儀器設(shè)備:
基因擴(kuò)增儀 (基因檢測(cè)DNA/RNA擴(kuò)增)→熒光定量PCR儀(核酸定量分析)→核酸提取儀(樣品DNA/RNA提?。?rarr;移液器(準(zhǔn)確量取特定體積溶液)→紫外燈或者消毒車 (空間環(huán)境消毒)→超凈工作臺(tái)(涉及對(duì)細(xì)菌的操作均需在超凈工作臺(tái)下完成 )→純水裝置(用于PCR,DNA測(cè)序需要超純水 電泳儀(水平電泳用于核酸DNA/RNA檢測(cè),垂直電泳用于蛋白檢測(cè),轉(zhuǎn)印電泳用于將蛋白轉(zhuǎn)印到膜上做western檢測(cè))→凝膠成像系統(tǒng)/紫外檢測(cè)儀(用于核酸瓊脂電泳和蛋白聚丙酰胺的觀察和拍照,紫外分析儀用于染色后核酸瓊脂電泳膠觀察,不能連接電腦)→電爐(電泳瓊脂凝膠加熱融化)
新型guan狀病毒(2019-nCov)核酸檢測(cè)流程
北京協(xié)和醫(yī)院近期發(fā)布了《新型guan狀病毒核酸檢測(cè)》標(biāo)準(zhǔn)操作流程。這為我們建設(shè)2019-nCov新型guan狀病毒P3實(shí)驗(yàn)室建設(shè)提供了科學(xué)指導(dǎo)。
(PCR核酸檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室布局建設(shè) SICOLAB)
具體檢測(cè)流程如下
一、核酸檢測(cè)前的生物安全防護(hù)(工作人員個(gè)人三級(jí)防護(hù)的穿戴)
1、穿戴流程:
在基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室的清潔區(qū)(更衣區(qū))或者普通實(shí)驗(yàn)室的潔凈區(qū),工作人員按順序依次穿戴好一次性帽子、醫(yī)用N95、一次性防hu服、一次性鞋套、一次性防水靴套、防護(hù)目鏡和雙層乳膠手套,進(jìn)入樣本處理工作區(qū)域或?qū)嶒?yàn)室。
2、要點(diǎn)提示:
2.1、具備標(biāo)準(zhǔn)基因擴(kuò)增布局條件的實(shí)驗(yàn)室,應(yīng)在清潔更衣區(qū)做好個(gè)人三級(jí)防護(hù),條件有限的實(shí)驗(yàn)室亦可選擇在一潔凈的實(shí)驗(yàn)室中按流程穿戴好個(gè)人三級(jí)防護(hù)。
2.2、需佩戴醫(yī)用N95,若無(wú)醫(yī)用N95,可以考慮用普通N95/KN95外加一次性外科的組合方式,但不要佩戴有呼吸閥的N95。
2.3、佩戴N95時(shí)需檢查密閉性,通過(guò)雙手按壓、深呼吸、左右轉(zhuǎn)頭等動(dòng)作嚴(yán)格檢查是否佩戴正確。
2.4、一次性防hu服已具備新型guan狀病毒核酸檢測(cè)的防護(hù)需求,有條件時(shí)可以考慮加穿一次性反穿隔離衣,穿衣時(shí)需由他人協(xié)助。
2.5、穿戴整齊的工作人員,應(yīng)按要求盡快進(jìn)入樣本處理的實(shí)驗(yàn)區(qū)域開展工作,嚴(yán)禁穿戴三級(jí)防護(hù)后再進(jìn)入普通實(shí)驗(yàn)區(qū)域或辦公區(qū)域。
二、樣本的滅活處理
1、操作流程:
兩名完成三級(jí)防護(hù)的工作人員,進(jìn)入樣本處理區(qū)或樣本處理實(shí)驗(yàn)室,將接收到的樣本二級(jí)包裝在安全柜內(nèi)打開,檢查樣本主容器是否為嚴(yán)格密閉;對(duì)密封袋表面進(jìn)行消毒后,對(duì)送檢樣本進(jìn)行56℃下30分鐘的滅活,滅活后的樣本管需在生物安全柜內(nèi)打開內(nèi)層的容器,將拭子保存液混勻后進(jìn)行分裝和用于核酸提取。
2、要點(diǎn)提示:
2.1、涉及高致病性病原微生物的實(shí)驗(yàn)室活動(dòng),需由兩名工作人員完成,其中一人負(fù)責(zé)主要實(shí)驗(yàn)操作,一人提供必要的協(xié)助。主操作者應(yīng)避免反復(fù)多次進(jìn)出安全柜。
2.2、滅活形式:可以采用水浴或空氣加熱形式完成滅活,采用空氣加熱時(shí)可適當(dāng)延長(zhǎng)滅活時(shí)間。有條件時(shí)可以采用小型化設(shè)備在安全柜內(nèi)操作,減少樣本進(jìn)出安全柜的次數(shù)。滅活前的樣本嚴(yán)禁在生物安全柜外打開和操作。
2.3、應(yīng)特別檢查采樣管是否擰緊、有無(wú)樣本溢漏等情況。
2.4、樣本管每次進(jìn)出安全柜均需對(duì)外表面進(jìn)行消毒。
2.5、應(yīng)就近配備適量的消毒處理物品,以防止實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程中可能發(fā)生的意外溢灑事故,有條件時(shí)建議在安全柜內(nèi)配備一次性吸水臺(tái)布。
三、樣本的核酸提取
1、手工核酸提取操作流程(以凱杰的52906柱提法核酸提取試劑盒為例)
1.1、裂解液配制:在基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室的試劑配制區(qū)或單獨(dú)的普通試劑配制實(shí)驗(yàn)室中,準(zhǔn)備核酸提取所需的洗液1(AW1)、洗液2(AW2)和carrier RNA。按照要求,分別向洗液1和洗液2中加入分子生物學(xué)級(jí)別的130ml和160ml的無(wú)水乙醇并及時(shí)做好標(biāo)記;取310μl洗脫液(AVE)溶解310μg/支的Carrier RNA。配置好后,通過(guò)傳遞窗進(jìn)入核酸提取區(qū)或由工作人員送入核酸提取實(shí)驗(yàn)室。
1.2、樣本裂解:取560μl AVL裂解液到1、5ml無(wú)菌EP管中,加入5、6μl配制好的Carrier RNA,再加入已經(jīng)滅活的140μl樣本(例如咽拭子、血漿等),混勻振蕩15秒,室溫靜置10分鐘,充分裂解樣本中的核酸。將EP管瞬時(shí)離心后加入560μl無(wú)水乙醇,充分混勻15秒,再次瞬時(shí)離心后備用。吸取630μl裂解產(chǎn)物,小心加入至離心柱中,8000rpm(或6000g)離心1分鐘,轉(zhuǎn)移離心柱至新收集管,將剩余630μl裂解產(chǎn)物加到離心柱中,重復(fù)上一離心操作(若樣本體積大于140μl,則在此步驟重復(fù)將630μl裂解產(chǎn)物過(guò)濾收集在一個(gè)離心柱上)。
1.3、核酸的洗滌:取500μl洗液1(AW1)至離心柱中,8000rpm(或6000g)離心1分鐘;換新收集管后,取500μl洗液2(AW2)至離心柱中,8000rpm(或6000g)離心1分鐘;換新收集管后,用14000rpm(或20000g)離心3分鐘,去除洗液2(AW2);換新收集管后,繼續(xù)用離心機(jī)大轉(zhuǎn)速(20000g)離心1分鐘,充分甩離殘留的洗液2(AW2)。
1.4、核酸的洗脫和回收:取一1、5ml無(wú)菌EP管,將離心柱放入其中,加入洗脫液(AVE)40~60μl,室溫靜置1分鐘后,用8000rpm離心1分鐘回收核酸,以備PCR檢測(cè)使用。
1.5、要點(diǎn)提示:
(1)、新鮮裂解液的配制應(yīng)盡可能在專門的潔凈區(qū)域或單獨(dú)的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行。
(2)、要用分子生物學(xué)級(jí)別的無(wú)水乙醇試劑進(jìn)行配制。
(3)、向離心柱中加入裂解產(chǎn)物、洗液時(shí)操作要非常小心,盡量將洗頭下探到離心柱內(nèi)部后靠管壁加樣,切忌出現(xiàn)溢灑后污染到離心柱的密封圈,這可能會(huì)導(dǎo)致乙醇?xì)埩簦种坪罄m(xù)PCR反應(yīng)。
(4)、從離心機(jī)中取出離心柱時(shí)應(yīng)小心操作,避免離心柱下緣被收集管中的濾過(guò)殘液污染。
(5)、加入洗液2(AW2)后的第二次空管全速離心非常關(guān)鍵,能幫助充分甩離離心柱濾膜中殘留的洗液2殘液,確保洗脫核酸的純度。
(6)、洗脫液加樣時(shí)需小心操作,確保洗脫液盡可能覆蓋全部離心柱濾膜,充分洗脫核酸,提高核酸提取的產(chǎn)量。
(7)、手工核酸提取可優(yōu)選使用檢測(cè)試劑盒說(shuō)明書推薦的配套手工提取試劑,也可選用通用手工提取試劑。
(8)、樣本處理過(guò)程中,工作人員覺(jué)得有必要時(shí),應(yīng)隨時(shí)更換新的外層乳膠手套。
2、采用核酸提取儀提取核酸的操作流程
根據(jù)核酸提取儀和試劑的說(shuō)明書準(zhǔn)備好提取試劑,取200μl樣本上機(jī)提取核酸,并按照要求回收提取好的核酸備用。
要點(diǎn)提示:
1、不同的提取儀器和試劑的提取效率可能存在差異,請(qǐng)一定嚴(yán)格按照提取試劑盒的說(shuō)明書進(jìn)行核酸提取操作。
2、有條件時(shí)可以考慮配備小型化的核酸提取儀在安全柜內(nèi)使用,以進(jìn)一步加強(qiáng)生物安全防護(hù);若使用在安全柜外的核酸提取儀,則一定要做好生物安全防護(hù)及樣本的防污染保護(hù)。
四、PCR體系的配制和模板加樣
1、操作流程:
在基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室的試劑配制區(qū)或單獨(dú)的實(shí)驗(yàn)室,配制PCR體系。根據(jù)試劑盒說(shuō)明書的要求,將試劑盒的不同組分(一般包括反應(yīng)液、酶、引物等)按照各自必須的體積量進(jìn)行配制混合,充分混勻并離心后,通過(guò)傳遞窗傳遞到核酸提取和加樣區(qū),或由專人從試劑配制實(shí)驗(yàn)室送至核酸提取和加樣實(shí)驗(yàn)室。在加樣生物安全柜內(nèi),根據(jù)檢測(cè)樣本例數(shù)分裝體系到每個(gè)反應(yīng)管中,逐一將樣本核酸加入到對(duì)應(yīng)的反應(yīng)管中,并加蓋密閉好PCR反應(yīng)管;每批次檢測(cè)需要做一個(gè)陽(yáng)性對(duì)照和3個(gè)陰性對(duì)照。
2、要點(diǎn)提示:
(1)、試劑配制必須嚴(yán)格在試劑配制區(qū)或單獨(dú)、潔凈的實(shí)驗(yàn)室和安全柜內(nèi)進(jìn)行,以確保試劑不會(huì)有被污染的可能。
(2)、試劑配制時(shí)要根據(jù)檢測(cè)樣本數(shù)量進(jìn)行合理配制,每批次檢測(cè)均需要包括3個(gè)陰性對(duì)照和1個(gè)陽(yáng)性對(duì)照的試劑,同時(shí)還需要考慮試劑分配過(guò)程中的正常損耗等消耗。
(3)、加樣可以和樣本處理/核酸提取在同一分區(qū)或同一間實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行,但如有條件hao在單獨(dú)的加樣區(qū)或至少使用安全柜進(jìn)行加樣。
(4)、體系分裝建議每次更換新的吸頭,避免反復(fù)使用帶來(lái)體積誤差和交叉污染。
(5)、應(yīng)配置體系加樣登記表,確保加樣過(guò)程準(zhǔn)確無(wú)誤。
(6)、PCR密閉管蓋應(yīng)特別謹(jǐn)慎,建議更換新的手套,防止手套等接觸管蓋內(nèi)部帶入污染的風(fēng)險(xiǎn)。
五、上機(jī)檢測(cè)及結(jié)果分析
1、操作流程:
在擴(kuò)增區(qū)或擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室,由專人取出配制好的PCR檢測(cè)管,混勻、離心后,小心上機(jī)檢測(cè),按照試劑盒說(shuō)明書設(shè)置擴(kuò)增參數(shù)并分析判讀結(jié)果。進(jìn)行結(jié)果分析時(shí),應(yīng)認(rèn)真閱讀試劑盒說(shuō)明書,在了解該試劑盒的靈敏度、檢測(cè)方法和局限性等技術(shù)特點(diǎn)的基礎(chǔ)上,結(jié)合該批次陰性質(zhì)控的結(jié)果,綜合判讀樣本的檢測(cè)結(jié)果。檢測(cè)結(jié)束后,為防止可能的擴(kuò)增污染,擴(kuò)增結(jié)束后的PCR管嚴(yán)禁開蓋或帶離擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室,應(yīng)盡快通過(guò)可密封塑料袋等容器盛裝密閉后,放入醫(yī)療垃圾桶中做進(jìn)一步處理。
2、要點(diǎn)提示:
(1)、因基因擴(kuò)增區(qū)存在污染的風(fēng)險(xiǎn),應(yīng)設(shè)專門的擴(kuò)增區(qū)域或在單獨(dú)的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行擴(kuò)增,必須和核酸提取、試劑配制區(qū)域有嚴(yán)格的物理分割。
(2)、不同操作區(qū)域的工作服不要混穿,特別是基因擴(kuò)增區(qū)的工作服,建議僅在擴(kuò)增區(qū)域或擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室內(nèi)使用。
(3)、熟悉檢測(cè)用PCR儀器的基本性能和特點(diǎn),能客觀分析判斷檢測(cè)結(jié)果。
六、檢測(cè)后的消毒處理
1、操作流程:
(1)、生物安全柜內(nèi):在完成樣本核酸提取后,應(yīng)在安全柜內(nèi)用75%消毒酒精對(duì)外層手套進(jìn)行消毒處理,并將外層手套取下后棄至安全柜內(nèi)的垃圾桶中。小心收納并丟棄使用過(guò)的一次性吸水臺(tái)布,用0、5%~1%的有效氯消毒劑或75%酒精擦拭安全柜臺(tái)面、移液器等安全柜內(nèi)全部?jī)x器的表面。將安全柜內(nèi)產(chǎn)生的新型guan狀病毒相關(guān)醫(yī)療垃圾經(jīng)3層包裝后,轉(zhuǎn)移至實(shí)驗(yàn)室的醫(yī)療垃圾桶中。開啟紫外燈照射生物安全柜,時(shí)間應(yīng)大于30分鐘。
(2)、樣本核酸提取工作人員實(shí)驗(yàn)室內(nèi):他人協(xié)助用0、5%~1%的有效氯消毒劑或75%酒精均勻噴灑內(nèi)層手套、袖口、手臂及隔離衣后,將外層反穿隔離衣脫下至新型guan狀病毒醫(yī)療垃圾桶中送高壓處理。
(3)、樣本處理實(shí)驗(yàn)室內(nèi):用0、5%~1%的有效氯消毒劑或75%酒精消毒實(shí)驗(yàn)室臺(tái)面和地面;開紫外燈進(jìn)行大于30分鐘的空間消毒。
(4)、工作人員摘脫三級(jí)防護(hù):在緩沖區(qū)戴新的外層手套,摘護(hù)目鏡置于75%酒精浸泡消毒,從頭開始,自上而下、由內(nèi)而外緩慢翻轉(zhuǎn)脫下一次性防hu服,直到將一次性防水靴套全部脫下,將防hu服置于新型guan狀病毒醫(yī)療垃圾桶中送高壓處理。摘kouzhao、帽子、內(nèi)層鞋套和內(nèi)層手套后同樣置于新型guan狀病毒醫(yī)療垃圾桶中送高壓處理。
(5)、新型guan狀病毒相關(guān)醫(yī)療垃圾:所有新型guan狀病毒相關(guān)醫(yī)療垃圾均需經(jīng)濕熱高壓滅菌后再作為普通醫(yī)療垃圾處理,且垃圾袋上應(yīng)標(biāo)注新型guan狀病毒醫(yī)療垃圾的相關(guān)信息。高壓處理前后的垃圾要嚴(yán)格區(qū)分,在高壓滅菌區(qū)域?qū)π滦蚲uan狀病毒醫(yī)療垃圾進(jìn)行濕熱高壓滅菌處理,高壓參數(shù)為121℃、30分鐘。高壓要做物理、生物指示,以確保高壓滅菌的效果。
2、要點(diǎn)提示:
(1)、生物安全柜內(nèi)是風(fēng)險(xiǎn)gao區(qū)域,操作者的外層手套經(jīng)消毒后必須脫在安全柜內(nèi)。
(2)、靴套或鞋套的主要作用是對(duì)操作者的腳和腿部進(jìn)行防護(hù),要求必須防水,以確保在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)發(fā)生意外遺灑時(shí)可隔離污染。
(3)、核酸提取儀內(nèi)部、生物安全柜內(nèi)部和實(shí)驗(yàn)室空間均應(yīng)進(jìn)行紫外線消毒,但紫外線對(duì)空氣的消毒效果好,對(duì)物體表面的消毒效果隨距離變遠(yuǎn)而減弱,故在紫外線消毒前,仍需對(duì)各種儀器表面、臺(tái)面、地面用消毒劑進(jìn)行擦拭消毒。
(4)、工作人員在摘脫個(gè)人三級(jí)防護(hù)后,仍應(yīng)參照實(shí)驗(yàn)室原有實(shí)驗(yàn)后操作流程進(jìn)行嚴(yán)格認(rèn)真的常規(guī)消毒處理,特別是實(shí)驗(yàn)后的手衛(wèi)生環(huán)節(jié)。
以上為SICOLAB整理,實(shí)驗(yàn)室整體設(shè)計(jì)建設(shè)工程、生物樣本建設(shè)工程、GMP環(huán)境建設(shè)工程、環(huán)保工程。